RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD49Q8WVL7 239 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 ESAMQ96AP7 390 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 RHBDF1Q96CC6 855 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 PBKQ96KB5 322 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 B4GALT7Q9UBV7 327 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 PSAT1Q9Y617 370 aa12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 FN1P02751 2386 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
TTPAL-203ENST00000372906 HSPB2A8KAH6 182 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 RTCAO00442 366 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TAPBPO15533 448 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 SH3BGRLO75368 114 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 RAF1P04049 648 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CD22P20273 847 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 HOXC12P31275 282 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 PAFAH1B1P43034 410 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ASCL1P50553 236 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 KCNJ2P63252 427 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CDKL1Q00532 357 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 HSPB2Q16082 182 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 MPEG1Q2M385 716 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CHSY3Q70JA7 882 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CAMKMTQ7Z624 323 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 BIVMQ86UB2 503 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 KRT78Q8N1N4 520 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TTLQ8NG68 377 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 OR5L2Q8NGL0 311 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 NEIL3Q8TAT5 605 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 PAQR8Q8TEZ7 354 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CFAP36Q96G28 342 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 EPB41L4BQ9H329 900 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 NT5DC2Q9H857 520 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ZFP64Q9NPA5 681 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 OARD1Q9Y530 152 aa12.33□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 MED12Q93074 2177 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 A0A088AWK7 358 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 DVL2O14641 736 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CTAGE8P0CG41 777 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ELK3P41970 407 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ZNF136P52737 540 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TAS2R39P59534 338 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 KEAP1Q14145 624 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 SPATA6LQ8N4H0 392 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 C18orf12Q96KH6 178 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TIMP4Q99727 224 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM79Q9BSE2 394 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ACKR4Q9NPB9 350 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 EDARQ9UNE0 448 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FBN3Q75N90 2809 aa12.32□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 DOCK7Q96N67 2140 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1W2PPR1 153 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TUBAL3A6NHL2 446 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 WASHC1A8K0Z3 465 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 EFCAB8A8MWE9 144 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FGF17O60258 216 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 EPPINO95925 133 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 IGKV3-11P04433 115 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 INHBBP09529 407 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 EPXP11678 715 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 HNMTP50135 292 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 DUSP8Q13202 625 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 SERTAD2Q14140 314 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 DOC2AQ14183 400 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FBXW10Q5XX13 1052 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM64Q6YI46 380 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 PRIMA1Q86XR5 153 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FBXW8Q8N3Y1 598 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ACOT4Q8N9L9 421 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 FAM13CQ8NE31 585 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 NUBPLQ8TB37 319 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ANKRD7Q92527 254 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 ARSGQ96EG1 525 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 MDFIQ99750 246 aa12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
TTPAL-203ENST00000372906 LYRM4Q9HD34 91 aa12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms