RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ALG3Q92685 438 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 MAP6Q96JE9 813 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP14Q9HCL3 533 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 BORCS7Q96B45 105 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRD-201ENST00000355233 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 CITED4Q96RK1 184 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRD-201ENST00000355233 PCYT2Q99447 389 aa4.72□□□□□ -1.65
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