RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 SEC22BO75396 215 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 IL6P05231 212 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PRPS2P11908 318 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 IL1RNP18510 177 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MAPK1P28482 360 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HSPA13P48723 471 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MED21Q13503 144 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 FAM53BQ14153 422 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SLC9A5Q14940 896 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SFT2D3Q587I9 215 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PAGE3Q5JUK9 113 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 FRG2Q64ET8 278 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LCN10Q6JVE6 187 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PROSER1Q86XN7 944 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 RNF175Q8N4F7 328 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CT55Q8WUE5 264 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 FRG2BQ96QU4 278 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HBEGFQ99075 208 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MS4A8Q9BY19 250 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 DPH1Q9BZG8 443 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 DPY30Q9C005 99 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 AICDAQ9GZX7 198 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CHST8Q9H2A9 424 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 KLHL31Q9H511 634 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 Q9H521 79 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ALG2Q9H553 416 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ACTL8Q9H568 366 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 AP3M1Q9Y2T2 418 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.27□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 USP24Q9UPU5 2620 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 LRIT2A6NDA9 550 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 C4orf51C9J302 202 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 C9J4A7 227 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 KLK10O43240 276 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 SH3BGRLO75368 114 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 TGFB1P01137 390 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 PDYNP01213 254 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 UMPSP11172 480 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 ALOX12P18054 663 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 TCN2P20062 427 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 FBLP22087 321 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 HTR1EP28566 365 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 OR1D4P47884 311 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 AVPR1BP47901 424 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 NEK2P51955 445 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 KIAA0040Q15053 153 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 ARHGAP40Q5TG30 622 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 NANOGP8Q6NSW7 305 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 FAM198BQ6UWH4 519 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 VASH2Q86V25 355 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 LILRA2Q8N149 483 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 COL26A1Q96A83 441 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 PKP2Q99959 881 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 NANOGQ9H9S0 305 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 ZNF304Q9HCX3 659 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 SCOCQ9UIL1 159 aa11.27□□□□□ -0.61
C16orf46-201ENST00000299578 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms