RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GHRLQ9UBU3 117 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MALT1Q9UDY8 824 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ASB4Q9Y574 426 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PEX10O60683 326 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OPN1SWP03999 348 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GJA1P17302 382 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCNJ5P48544 419 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 DGKQP52824 942 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MZT1Q08AG7 82 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GNMTQ14749 295 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 VMACQ2NL98 169 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SEC14L1Q92503 715 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FAM46BQ96A09 425 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 S100PBPQ96BU1 408 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PEBP4Q96S96 227 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR10A4Q9H209 315 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KCNK6Q9Y257 313 aa6.93□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HSPA12AO43301 675 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LILRB3O75022 631 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZNF623O75123 536 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GPR32O75388 356 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LEFTY1O75610 366 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MSR1P21757 451 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RORAP35398 523 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC6A8P48029 635 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PIGGQ5H8A4 983 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 POF1BQ8WVV4 589 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TM9SF4Q92544 642 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FOXJ1Q92949 421 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MR1Q95460 341 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PFDN5Q99471 154 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 KLF15Q9UIH9 416 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 H7C417 338 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ACOT7O00154 380 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 B4GALT2O60909 372 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GNAO1P09471 354 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CD3GP09693 182 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 CDK2P24941 298 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MAGEA8P43361 318 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A3P48764 834 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMEM198Q66K66 360 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SIX4Q9UIU6 781 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 LPLP06858 475 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLURP2P0DP57 97 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 AGTR1P30556 359 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 TDGQ13569 410 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 MYRFLQ96LU7 910 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 COPZ2Q9P299 210 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 A0A0G2JMP0 313 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 A0A1B0GVT2 93 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PRAMEF2O60811 474 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 S1PR4O95977 384 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IFNA5P01569 189 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 IRF2P14316 349 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 PORP16435 677 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 EDNRBP24530 442 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 OR4D2P58180 307 aa6.92□□□□□ -1.3
CPS1-201ENST00000233072 SSTP61278 116 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms