RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CCRL2	O00421	344 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PLPP1	O14494	284 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ACR	P10323	421 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CNR2	P34972	360 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F2	P78329	520 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ARRDC3	Q96B67	414 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	UCK2	Q9BZX2	261 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MKLN1	Q9UL63	735 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		17.53	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BP5	O60239	455 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	RECK	O95980	971 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	PTTG1	O95997	202 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	OSM	P13725	252 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ADRB3	P13945	408 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	GRK5	P34947	590 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM11A	P58511	58 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	MED22	Q15528	200 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF607	Q96SK3	696 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	CENPO	Q9BU64	300 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	DYRK4	Q9NR20	520 aa		17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	17.52	■□□□□ 0.4
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		17.52	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	FAAH	O00519	579 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	MFN2	O95140	757 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	BCHE	P06276	602 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ITGB8	P26012	769 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	SLC15A1	P46059	708 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	METAP1	P53582	386 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ILK	Q13418	452 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	DCST1	Q5T197	706 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	AMZ2	Q86W34	360 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	IL17F	Q96PD4	163 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A8	Q9BY19	250 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	RHCG	Q9UBD6	479 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	INSL6	Q9Y581	213 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	NOTCH4	Q99466	2003 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	FFAR1	O14842	300 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TBX1	O43435	398 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	SNX4	O95219	450 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ERG	P11308	486 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	POU1F1	P28069	291 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ETV6	P41212	452 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	LIM2	P55344	173 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	NTHL1	P78549	312 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	STEAP3	Q658P3	488 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	MMP21	Q8N119	569 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM19	Q96HH6	336 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	POLE4	Q9NR33	117 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	INIP	Q9NRY2	104 aa		17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	17.51	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559		M0R129	80 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TLR4	O00206	839 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA0355	O15063	1070 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	BSG	P35613	385 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	CCR8	P51685	355 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	RHAG	Q02094	409 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	POC5	Q8NA72	575 aa		17.5	■□□□□ 0.39
RRN3-205	ENST00000563559	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	17.5	■□□□□ 0.39

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