RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 LSM1O15116 133 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 AIFM1O95831 613 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 HPP00738 406 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 NR2F6P10588 404 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 COX6A1P12074 109 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 KIAA0040Q15053 153 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 TANKQ92844 425 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 C3orf30Q96M34 536 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ING2Q9H160 280 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ITPR1Q14643 2758 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 TGFBR3LH3BV60 316 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 MYO1DO94832 1006 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PPP2R1BP30154 601 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 GSTM5P46439 218 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 OR4D2P58180 307 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PCOLCEQ15113 449 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CPZQ66K79 652 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CKAP2Q8WWK9 683 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 TTC9Q92623 222 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 EXTL1Q92935 676 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 C19orf60Q96EN9 201 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 FCRL1Q96LA6 429 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 EBPLQ9BY08 206 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.04■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 SFT2D3Q587I9 215 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.04■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.04■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 C1orf226A1L170 272 aa16.03■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 LOC400499M0QZD8 3231 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 MASP2O00187 686 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PGRMC2O15173 223 aa16.03■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 PEX11AO75192 247 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP6AP2O75787 350 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 SOX8P57073 446 aa16.03■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 BIKQ13323 160 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 LINC00303Q3SY05 128 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 GALNTL6Q49A17 601 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 CLEC1AQ8NC01 280 aa16.03■□□□□ 0.16
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RABGGTA-203ENST00000543002 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 MAGEB18Q96M61 343 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 C7orf26Q96N11 449 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 LPAR4Q99677 370 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa16.03■□□□□ 0.16
RABGGTA-203ENST00000543002 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
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