RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MCIDASD6RGH6 385 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OGG1O15527 345 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRGAP3O43295 1099 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RGS10O43665 173 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBP1P09467 338 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EBLN1P0CF75 366 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGF5P12034 268 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF44P15621 663 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF12P17014 697 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNA3P22001 575 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC6A2P23975 617 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACKR3P25106 362 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HTR2AP28223 471 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CSF2RBP32927 897 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTPN7P35236 360 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC6A9P48067 706 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MGAT3Q09327 533 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC39A6Q13433 755 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ITGA9Q13797 1035 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EXOC3L4Q17RC7 722 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BSXQ3C1V8 233 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MTX3Q5HYI7 312 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF691Q5VV52 312 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TDRPQ86YL5 185 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C4orf19Q8IY42 314 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LILRA2Q8N149 483 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM109AQ8N4B1 249 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BCORP1Q8N888 145 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIGBQ92521 554 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMBIM1Q969X1 311 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLHL29Q96CT2 875 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 R3HDM4Q96D70 268 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASB9Q96DX5 294 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM210BQ96KR6 192 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C4orf36Q96KX1 117 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5B2Q96R09 309 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRRQ9GZT4 340 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WWP1Q9H0M0 922 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HRH4Q9H3N8 390 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRABDQ9H4I3 376 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTR8Q9H981 624 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COA4Q9NYJ1 87 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYOTQ9UBF9 498 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PISDQ9UG56 409 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PQF6 199 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM213A2RRL7 107 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C5orf60A6NFR6 353 aa6.76□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRR19A6NJB7 356 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms