RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 DUSP7Q16829 419 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 METRNLQ641Q3 311 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF367Q7RTV3 350 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC38A5Q8WUX1 472 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 CLN6Q9NWW5 311 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 MS4A12Q9NXJ0 267 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC23A2Q9UGH3 650 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM29Q9UKF5 820 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAP00813 363 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PERM1Q5SV97 790 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 NUDT13Q86X67 352 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 CDCA4Q9BXL8 241 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 SLAMF7Q9NQ25 335 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 DOLKQ9UPQ8 538 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 METTL15A6NJ78 407 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 GASTP01350 101 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 BCHEP06276 602 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 CAMK1Q14012 370 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 AMER2Q8N7J2 671 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 RASSF5Q8WWW0 418 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 RGMAQ96B86 450 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 ITPKCQ96DU7 683 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM247A6NEH6 219 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 MFN2O95140 757 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 POU2F1P14859 743 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ALDH9A1P49189 494 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 CYP4F2P78329 520 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 IFITM3Q01628 133 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 C6orf120Q7Z4R8 191 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 B3GNT7Q8NFL0 401 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM19Q96HH6 336 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM210AQ96ND0 272 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 NEURL2Q9BR09 285 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TAF4O00268 1085 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 RTCAO00442 366 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3BP5O60239 455 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 CHMP24386 653 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 CDK3Q00526 305 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ARMCX4Q5H9R4 360 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 MGAT4BQ9UQ53 548 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 KLK4Q9Y5K2 254 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 DSPPQ9NZW4 1301 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ALPK3Q96L96 1907 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 KRBA1A5PL33 1030 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 NDUFS4O43181 175 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TGFBR1P36897 503 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 MLC1Q15049 377 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB42Q8N4Z0 105 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF607Q96SK3 696 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 FFAR1O14842 300 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 KMOO15229 486 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 PTHP01270 115 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 PCCBP05166 539 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 IMPDH2P12268 514 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 PIPP12273 146 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 TGM1P22735 817 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 RGS6P49758 472 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 LIM2P55344 173 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 SMIM11AP58511 58 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 LACC1Q8IV20 430 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 DHRS1Q96LJ7 313 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 MENTQ9BUN1 341 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 UCK2Q9BZX2 261 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 RHCGQ9UBD6 479 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-202ENST00000399409 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms