RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NETO1Q8TDF5 533 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PIGKQ92643 395 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RAD21L1Q9H4I0 556 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DAPP1Q9UN19 280 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GLOD5A6NK44 160 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 B3GALT2O43825 422 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TNFRSF21O75509 655 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TIPRLO75663 272 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 KRT75O95678 551 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NR2F6P10588 404 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 BMP2P12643 396 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GFERP55789 205 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TNFRSF17Q02223 184 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RUNX2Q13950 521 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 COX20Q5RI15 118 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SAXO2Q658L1 398 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FAM162AQ96A26 154 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NEURL3Q96EH8 262 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 C10orf90Q96M02 699 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NLNQ9BYT8 704 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LYRM4Q9HD34 91 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PI4KAP42356 2102 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TXNDC9O14530 226 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NUDT7P0C024 238 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FCGR1AP12314 374 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ALDH4A1P30038 563 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NTSP30990 170 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LIM2P55344 173 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PDSS2Q86YH6 399 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EID3Q8N140 333 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CARFQ8N187 725 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SAP25Q8TEE9 199 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NCLNQ969V3 563 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TGM7Q96PF1 710 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DUSP23Q9BVJ7 150 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TMEM38AQ9H6F2 299 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NCOR1O75376 2440 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RAP2AP10114 183 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ETFAP13804 333 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FASP25445 335 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PCGF2P35227 344 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SOAT1P35610 550 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 OR1D5P58170 312 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GPLD1P80108 840 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RBBP4Q09028 425 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HSPB3Q12988 150 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HLA-BQ31612 363 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 RNF130Q86XS8 419 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NCSTNQ92542 709 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZNF681Q96N22 645 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.61□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 YKT6O15498 198 aa14.6□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 B4GAT1O43505 415 aa14.6□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 B4GALT2O60909 372 aa14.6□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJB6O75190 326 aa14.6□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 C9P02748 559 aa14.6□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CTSBP07858 339 aa14.6□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms