RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP14A8MT82 685 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 XPNPEP2O43895 674 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 FPR1P21462 350 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NR4A1P22736 598 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT2B10P36537 528 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALNT1Q00973 533 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF547Q8IVP9 402 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NDNFQ8TB73 568 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 WWOXQ9NZC7 414 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 UTS2RQ9UKP6 389 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF4O00268 1085 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NUAK1O60285 661 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EPB42P16452 691 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ID4P47928 161 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CTSCP53634 463 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ERICH5Q6P6B1 374 aa25.11■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 ULK4Q96C45 1275 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BOCQ9BWV1 1114 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PARVBQ9HBI1 364 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 ACOT13Q9NPJ3 140 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC23A2Q9UGH3 650 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 OSGIN1Q9UJX0 560 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BCKDHAP12694 445 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 PROX2Q3B8N5 592 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EGFL8Q99944 293 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP27Q9H306 513 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 RP1P56715 2156 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 LMO7DNF2Z398 122 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK5O95279 499 aa25.1■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF8Q7Z7C8 310 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4Z1Q86W10 505 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4C6Q8NH72 309 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS12Q96DT0 336 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SERHLQ9NQF3 203 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CRLS1Q9UJA2 301 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AG2A6NM03 316 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EVPLLA8MZ36 301 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB8E9PQR5 432 aa25.09■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF181Q2M3W8 571 aa25.09■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 OR2M4Q96R27 311 aa25.09■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 CASC3O15234 703 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 EML2O95834 649 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB9P28065 219 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB1P30740 379 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC1P48995 793 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.08■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT8Q8WV74 236 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 DSN1Q9H410 356 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK6Q9Y257 313 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-201ENST00000246533 U3KQA8 63 aa25.08■■□□□ 1.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 FMO3P31513 532 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DAPP51397 102 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 VBP1P61758 197 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM53Q6P2H8 277 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PATE1Q8WXA2 126 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 APOLD1Q96LR9 279 aa25.08■■□□□ 1.6
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