RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 CLCN4P51793 760 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PAX8Q06710 450 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 STXBP2Q15833 593 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 MS4A18Q3C1V0 323 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM64Q6YI46 380 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 FAM131BQ86XD5 332 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ELMOD1Q8N336 334 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SLC43A2Q8N370 569 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GPATCH11Q8N954 259 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SPATA18Q8TC71 538 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SMPDL3AQ92484 453 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 WBP1Q96G27 269 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GAL3ST4Q96RP7 486 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 THAP9Q9H5L6 903 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 MAGEF1Q9HAY2 307 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 COMMD8Q9NX08 183 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM129A0AVI4 362 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PSMD3O43242 534 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 B4GAT1O43505 415 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TNFSF12O43508 249 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SYT7O43581 403 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ATP6V1G1O75348 118 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 OLFM2O95897 454 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 MT-ND3P03897 115 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 NUDT17P0C025 328 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ODC1P11926 461 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 STMN1P16949 149 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ACKR3P25106 362 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SHC1P29353 583 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CAPGP40121 348 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TAF6P49848 677 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 NT5C2P49902 561 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 KCNK10P57789 538 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 HFEQ30201 348 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 Q8N377 158 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 NEK11Q8NG66 645 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 HAS2Q92819 552 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ATP6V0BQ99437 205 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF319Q9P2F9 582 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 KCNK6Q9Y257 313 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CEP164Q9UPV0 1460 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PEG3Q9GZU2 1588 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PPR1 153 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SLC15A5A6NIM6 579 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 INPP4BO15327 924 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 VEGFDO43915 354 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 LYNP07948 512 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 UGT1A6P19224 532 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 OXTRP30559 389 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 EVCP57679 992 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GPR50Q13585 617 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GIT2Q14161 759 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GCKRQ14397 625 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF146Q15072 292 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 UPP1Q16831 310 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF410Q86VK4 478 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TRPV3Q8NET8 790 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GPR148Q8TDV2 347 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GANCQ8TET4 914 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 FAM222BQ8WU58 562 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 GUCD1Q96NT3 240 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PRAM1Q96QH2 718 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF665Q9H7R5 613 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 CTSZQ9UBR2 303 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRK-215ENST00000498284 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms