RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SNX15Q9NRS6 342 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1CQ13936 2221 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A12O75746 678 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 JAK1P23458 1154 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 AHRP35869 848 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RFC3P40938 356 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GDF5P43026 501 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SERPINB8P50452 374 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RPTNQ6XPR3 784 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 QSOX2Q6ZRP7 698 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CEP97Q8IW35 865 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CA13Q8N1Q1 262 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ATL1Q8WXF7 558 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SMIM10Q96HG1 83 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PHF12Q96QT6 1004 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PELI2Q9HAT8 420 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8RI6L899 631 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ASNA1O43681 348 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NME2P1O60361 137 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 COX6B1P14854 86 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CREB1P16220 341 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NME2P22392 152 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R1BP30154 601 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PTGER1P34995 402 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 GMPRP36959 345 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CASP6P55212 293 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MLF1P58340 268 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 BTN3A2P78410 334 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 RUNX2Q13950 521 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TSNQ15631 228 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 KRTCAP3Q53RY4 240 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MTFR2Q6P444 385 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CNPY4Q8N129 248 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SPATA6LQ8N4H0 392 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 AGAP11Q8TF27 550 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 EGFL8Q99944 293 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MED4Q9NPJ6 270 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MEMO1Q9Y316 297 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ADAM10O14672 748 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 MYO1DO94832 1006 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 WDR47O94967 919 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 C2P06681 752 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 PYGBP11216 843 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ABOP16442 354 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 STMN1P16949 149 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 ZNF24P17028 368 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 TYK2P29597 1187 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 KIR3DL1P43629 444 aa11.79□□□□□ -0.52
PRAME-212ENST00000485532 CYB561P49447 251 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms