RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLDN4O14493 209 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FCHO1O14526 889 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC22A2O15244 555 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC22A3O75751 556 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0754O94854 1291 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNFSF15O95150 251 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTRK1P04629 796 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CTSBP07858 339 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 G6PDP11413 515 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX7A2P14406 83 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DRD2P14416 443 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL10P22301 178 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP2R1BP30154 601 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ALDH9A1P49189 494 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DIO3P55073 304 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAB38P57729 211 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNK10P57789 538 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAS2R50P59544 299 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TNFRSF17Q02223 184 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OCA2Q04671 838 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLC1Q07866 573 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA0040Q15053 153 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM198Q66K66 360 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PACS2Q86VP3 889 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM10Q96HG1 83 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FCRL1Q96LA6 429 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DLL3Q9NYJ7 618 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSME2Q9UL46 239 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DAPP1Q9UN19 280 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAU2Q9Y6X3 613 aa9.71□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf226A1L170 272 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C4orf51C9J302 202 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHST10O43529 356 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKAP10O43572 662 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXS1O43638 330 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMPRSS11DO60235 418 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK17BO94768 372 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRATO95237 230 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B3GALT4O96024 378 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL3P08700 152 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD63P08962 238 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD82P27701 267 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NTSP30990 170 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ETV5P41161 510 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIM2P55344 173 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NME5P56597 212 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLDN8P56748 225 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OLR1P78380 273 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAE1P78406 368 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SHC2P98077 582 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C2orf80Q0P641 193 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FOXC1Q12948 553 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTGR1Q14914 329 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PDSS2Q86YH6 399 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MR1Q95460 341 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPCDCQ96CD2 204 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NXPE2Q96DL1 559 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTERF3Q96E29 417 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms