RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409457.5

AGAP1-204, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene AGAP1, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AGAP1-204	ENST00000409457	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		27.59	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	RNF44	Q7L0R7	432 aa		27.59	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		27.59	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	KCT2	Q8NC54	265 aa		27.59	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		27.59	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	PVR	P15151	417 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	ADRM1	Q16186	407 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	ANKFN1	Q8N957	763 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	NETO1	Q8TDF5	533 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	NCLN	Q969V3	563 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	SEPHS2	Q99611	448 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	OLAH	Q9NV23	265 aa		27.58	■■■□□ 2.01
AGAP1-204	ENST00000409457	TYRP1	P17643	537 aa		27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	MVD	P53602	400 aa		27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	AQP4	P55087	323 aa		27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CERS1	P27544	350 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	TSSK4	Q6SA08	328 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	SMIM10	Q96HG1	83 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457		V9GYQ6	96 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	TMEM131	Q92545	1883 aa		27.57	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	LILRA5	A6NI73	299 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	P2RX6	O15547	441 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	NTRK1	P04629	796 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	IL1RN	P18510	177 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	PPP1CA	P62136	330 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	KLHL35	Q6PF15	583 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	C5AR2	Q9P296	337 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	TPST1	O60507	370 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	PIAS2	O75928	621 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	UBXN7	O94888	489 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	RAP2A	P10114	183 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	UQCRC2	P22695	453 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	FNTB	P49356	437 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	VEZF1	Q14119	521 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	UCN3	Q969E3	161 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	EME1	Q96AY2	570 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	RNF145	Q96MT1	663 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CHID1	Q9BWS9	393 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		27.56	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457		A0A1W2PR48	441 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	URAD	A6NGE7	173 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	BTN3A2	P78410	334 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	MLC1	Q15049	377 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2	4e-7	■■■□□ 19
AGAP1-204	ENST00000409457	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	FBXO30	Q8TB52	745 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	CHRNB3	Q05901	458 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		27.55	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457		H0YGG7	62 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	PRAMEF10	O60809	474 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	KRT75	O95678	551 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	TDGF1	P13385	188 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	FADD	Q13158	208 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	ATP6AP1	Q15904	470 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	EID3	Q8N140	333 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
AGAP1-204	ENST00000409457	BTBD9	Q96Q07	612 aa		27.54	■■■□□ 2

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