RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 EXT1Q16394 746 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR5M10Q6IEU7 315 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GALNT10Q86SR1 603 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SYVN1Q86TM6 617 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPR180Q86V85 440 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MED18Q9BUE0 208 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LHPPQ9H008 270 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNN2Q9H2S1 579 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NGBQ9NPG2 151 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GALPQ9UBC7 116 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NDRG3Q9UGV2 375 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMCO1Q9UM00 188 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS21Q9Y6M0 314 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PQM1 296 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF33A8MVX0 844 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 E7ESA3 106 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 H3BML4 177 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DVL2O14641 736 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PCDH7O60245 1069 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DDAH2O95865 285 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PEX11BO96011 259 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OPN1LWP04000 364 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD2P08910 425 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 AHCYP23526 432 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IL32P24001 234 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CADP27708 2225 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PTGS2P35354 604 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM23P36406 574 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAGEA6P43360 314 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC10A1Q14973 349 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MED25Q71SY5 747 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 P3H2Q8IVL5 708 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TEX26Q8N6G2 289 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PIF1Q9H611 641 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PDFQ9HBH1 243 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa4.22□□□□□ -1.73
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PTPRC-201ENST00000348564 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ALOX5P09917 674 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00032P0C843 101 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MPC1LP0DKB6 136 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CYP4B1P13584 511 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NOS3P29474 1203 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN7P41732 249 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGDIAP52565 204 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DIO3P55073 304 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DCDC1P59894 354 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HERVK_113P63132 956 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-8P63133 956 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RALGDSQ12967 914 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NAB1Q13506 487 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GBX1Q14549 363 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GPR68Q15743 365 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 GSTA3Q16772 222 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FRG2Q64ET8 278 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR2L3Q8NG85 312 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR2L8Q8NGY9 312 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF480Q8WV37 535 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PHF12Q96QT6 1004 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FRG2BQ96QU4 278 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PITPNM3Q9BZ71 974 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TXLNGYQ9BZA5 131 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP69BQ9UJL9 534 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ERVK-19Q9WJR5 959 aa4.22□□□□□ -1.73
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