RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 TAS2R7Q9NYW3 318 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ASB4Q9Y574 426 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PDPK1O15530 556 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF10O60809 474 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 GUCY1B2O75343 617 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 MANFP55145 182 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 C21orf59P57076 290 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 PPP1CAP62136 330 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZXDAP98168 799 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ANKFN1Q8N957 763 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 OR5P2Q8WZ92 322 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SPATA9Q9BWV2 254 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 TRIM4Q9C037 500 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 CHST8Q9H2A9 424 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SLAMF7Q9NQ25 335 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.21■□□□□ 0.51
UPP1-201ENST00000331803 FAM149AA5PLN7 773 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 SERPINA1P01009 418 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 RAP2AP10114 183 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CERS1P27544 350 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 MVDP53602 400 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 BTN3A2P78410 334 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CHRNB3Q05901 458 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 TLDC1Q6P9B6 456 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ENPP6Q6UWR7 440 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 EHD3Q9NZN3 535 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ATG4BQ9Y4P1 393 aa18.2■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 LMO7DNF2Z398 122 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 NOBOXO60393 691 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 MT-ND1P03886 318 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 NUDT7P0C024 238 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 HOXA6P31267 233 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 FRKP42685 505 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CRATP43155 626 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CAMKVQ8NCB2 501 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 OR52N2Q8NGI0 321 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 OR5AK3PQ8NH89 298 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CIB1Q99828 191 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 VCXQ9H320 206 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 COQ10BQ9H8M1 238 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ACSL6Q9UKU0 697 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 POMT2Q9UKY4 750 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PR48 441 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 P2RX6O15547 441 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 SDC3O75056 442 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 PRKD3O94806 890 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 UBXN7O94888 489 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 UQCRC2P22695 453 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 SOAT1P35610 550 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 VEZF1Q14119 521 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 DEFB133Q30KQ1 61 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 OR4N4Q8N0Y3 316 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CXorf36Q9H7Y0 433 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 UCK1Q9HA47 277 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 OLAHQ9NV23 265 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 SNX8Q9Y5X2 465 aa18.19■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 URADA6NGE7 173 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 GLOD5A6NK44 160 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 WASHC1A8K0Z3 465 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 H0YGG7 62 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 CCT8P50990 548 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 BIRC2Q13490 618 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 ATP6AP1Q15904 470 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 COX20Q5RI15 118 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 KLHL35Q6PF15 583 aa18.18■□□□□ 0.5
UPP1-201ENST00000331803 RNF44Q7L0R7 432 aa18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms