RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 COPZ2Q9P299 210 aa21.02■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 EFCAB14O75071 495 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ANXA9O76027 345 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 LHCGRP22888 699 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 EPHA2P29317 976 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CSKP41240 450 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CRISP3P54108 245 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 OR11H4Q8NGC9 324 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PSMG2Q969U7 264 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PHF11Q9UIL8 331 aa21.01■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 LINC00032P0C843 101 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 HSMCR30P0CW71 290 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 HK1P19367 917 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CAPZA2P47755 286 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 HERVK_113P63132 956 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 RPP38P78345 283 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 NFKB2Q00653 900 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ZFAND4Q86XD8 727 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 DENND6AQ8IWF6 608 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C19orf18Q8NEA5 215 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 EXOC2Q96KP1 924 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-6Q9BXR3 956 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 MIXL1Q9H2W2 232 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CBX4O00257 560 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ARNTLO00327 626 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PSMD3O43242 534 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 FOXA1P55317 472 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CTBP1Q13363 440 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CHMP1BQ7LBR1 199 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 RNF135Q8IUD6 432 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 OR52N1Q8NH53 320 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ZFPM2Q8WW38 1151 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 IGSF21Q96ID5 467 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ABCB9Q9NP78 766 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 MID1IP1Q9NPA3 183 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 NT5MQ9NPB1 228 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 SDHAF3Q9NRP4 125 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 DRGXA6NNA5 263 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 QSOX1O00391 747 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CXCR6O00574 342 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CFDP00746 253 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 BTG1P62324 171 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 FCN2Q15485 313 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 TMEM107Q6UX40 140 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CTSFQ9UBX1 484 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 LYRM1O43325 122 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 GJB5O95377 273 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C9P02748 559 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 GLAP06280 429 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 GEMP55040 296 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CEP68Q76N32 757 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PGBD5Q8N414 524 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.99■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 STSP08842 583 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ACVRL1P37023 503 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ZNF81P51508 661 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PWP1Q13610 501 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PCID2Q5JVF3 399 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 BICRALQ6AI39 1079 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 GPR149Q86SP6 731 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 MPTX1A8MV57 137 aa20.98■□□□□ 0.95
PITX1-201ENST00000265340 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms