RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 EIPR1Q53HC9 387 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCDC80Q76M96 950 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CHST14Q8NCH0 376 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AMBNQ9NP70 447 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TVP23BQ9NYZ1 205 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ALPPP05187 535 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 STSP08842 583 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ETFAP13804 333 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TIMP2P16035 220 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C21orf58P58505 322 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 IHHQ14623 411 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZFP69Q49AA0 526 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC36A4Q6YBV0 504 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NLRP8Q86W28 1048 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OOSP2Q86WS3 158 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GGHQ92820 318 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MGLLQ99685 303 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ANKMY1Q9P2S6 941 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 STUB1Q9UNE7 303 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DUXAA6NLW8 204 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KMOO15229 486 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 STX11O75558 287 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HMGN1P05114 100 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LCKP06239 509 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BMP1P13497 986 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 VLDLRP98155 873 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PTPRRQ15256 657 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BICRALQ6AI39 1079 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAHD1Q6P587 224 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CEP68Q76N32 757 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SETD6Q8TBK2 473 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SERHLQ9NQF3 203 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GPR34Q9UPC5 381 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DLGAP1O14490 977 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HAT1O14929 419 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CASKO14936 926 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NDUFS4O43181 175 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC16A8O95907 504 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ARAFP10398 606 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GJA1P17302 382 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR1E2P47887 323 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UBE3AQ05086 875 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 XAF1Q6GPH4 301 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 METTL4Q8N3J2 472 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 COQ8BQ96D53 544 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 EGLN2Q96KS0 407 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.47□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TTC34A8MYJ7 566 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 UPK1AO00322 258 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0513O60268 411 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RFPL2O75678 378 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C4BPBP20851 252 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMEM35AQ53FP2 167 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 C11orf74Q86VG3 221 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MYOCQ99972 504 aa8.46□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.46□□□□□ -1.05
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