RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM149AA5PLN7 773 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 OR5K3A6NET4 321 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 PRKD3O94806 890 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 NXPH1P58417 271 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FOLH1Q04609 750 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 VAC14Q08AM6 782 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MED21Q13503 144 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FKBP9P1Q75LS8 142 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 NLNQ9BYT8 704 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ABCG4Q9H172 646 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ASB4Q9Y574 426 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.35■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 URADA6NGE7 173 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CLOCKO15516 846 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 PCGF2P35227 344 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MVDP53602 400 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MLC1Q15049 377 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 TEAD4Q15561 434 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ARMC6Q6NXE6 501 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 LMX1AQ8TE12 382 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 PYURFQ96I23 114 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF597Q96LX8 424 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 TRIM4Q9C037 500 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 UCK1Q9HA47 277 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 VILLO15195 856 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CTSVO60911 334 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CKMT2P17540 419 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 KDELR2P33947 212 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 SOAT1P35610 550 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CRATP43155 626 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FASLGP48023 281 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.853e-7■■■■□ 25.9
RHBDD2-201ENST00000006777 RBBP4Q09028 425 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MAMSTRQ6ZN01 415 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 EML5Q05BV3 1969 aa20.34■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 BCKDHBP21953 392 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 RAB8AP61006 207 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 KLHL35Q6PF15 583 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC29A1Q99808 456 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 SLAMF7Q9NQ25 335 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 GPATCH2Q9NW75 528 aa20.33■□□□□ 0.85
RHBDD2-201ENST00000006777 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 A0A0J9YVX5 310 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 TNFRSF21O75509 655 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 PRSS23O95084 383 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 CERS1P27544 350 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 NKG7Q16617 165 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 NRF1Q16656 503 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 RNF44Q7L0R7 432 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 SPRED1Q7Z699 444 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 KCT2Q8NC54 265 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 RSC1A1Q92681 617 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 C5AR2Q9P296 337 aa20.32■□□□□ 0.84
RHBDD2-201ENST00000006777 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.5 ms