RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 PERM1Q5SV97 790 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PLXDC1Q8IUK5 500 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CSNK1A1LQ8N752 337 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF148Q8N7C7 305 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJB8Q8NHS0 232 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM125Q96AQ2 219 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MIEF2Q96C03 454 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ITCHQ96J02 903 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 INPP5KQ9BT40 448 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM8Q9BZR9 551 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC6A13Q9NSD5 602 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CMTM6Q9NX76 183 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 VAPAQ9P0L0 249 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SEMA5BQ9P283 1151 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CD300AQ9UGN4 299 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ERVK-11Q9UQG0 969 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ASB4Q9Y574 426 aa24.72■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PRORSD1PA6NEY8 169 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TBX19O60806 448 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CTSBP07858 339 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SLAMF1Q13291 335 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC9A5Q14940 896 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MPEG1Q2M385 716 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NANOGP8Q6NSW7 305 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PPCDCQ96CD2 204 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NANOGQ9H9S0 305 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM9Q9P0T7 183 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHL3Q9UH77 587 aa24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A096LPI6 279 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 URADA6NGE7 173 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ERN1O75460 977 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 BTN3A2P78410 334 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 HEPACAMQ14CZ8 416 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MUM1Q2TAK8 710 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 RABL3Q5HYI8 236 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CYB5D1Q6P9G0 228 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 USP53Q70EK8 1073 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC3Q9BQI4 270 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ATAD3AQ9NVI7 634 aa24.7■■□□□ 1.55
SCAMP4-210ENST00000588555 UNC13CQ8NB66 2214 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SPEGQ15772 3267 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CPED1A4D0V7 1026 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K7O43318 606 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 MGRN1O60291 552 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CDKN2CP42773 168 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SQSTM1Q13501 440 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PROX2Q3B8N5 592 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC115Q96NT0 180 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB23Q9ULC3 237 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 POMPQ9Y244 141 aa24.7■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CIB2O75838 187 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF883P0CG24 379 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 GTDC1Q4AE62 458 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ANXA8L1Q5VT79 327 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ABHD13Q7L211 337 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 CLECL1Q8IZS7 167 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD27Q96NW4 1050 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE7BQ9NP56 450 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 MIEF1Q9NQG6 463 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 BTNL2Q9UIR0 455 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ATG4BQ9Y4P1 393 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa24.69■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ALOX12P18054 663 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ME2P23368 584 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPC1P48995 793 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PRTGQ2VWP7 1150 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 DEFB134Q4QY38 66 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa24.68■■□□□ 1.54
SCAMP4-210ENST00000588555 LAIR1Q6GTX8 287 aa24.68■■□□□ 1.54
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