RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PPB8 328 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PRS3 328 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEB16A2A368 324 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 KIR3DP1A8MWS1 328 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 KLK8O60259 260 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ITGA10O75578 1167 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEA6P43360 314 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CCR8P51685 355 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CDK16Q00536 496 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 GPS1Q13098 491 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 PWP1Q13610 501 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 RUNX2Q13950 521 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 QSOX2Q6ZRP7 698 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 EID3Q8N140 333 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CA13Q8N1Q1 262 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM156Q8N614 296 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 OR56A3Q8NH54 315 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 NT5CQ8TCD5 201 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FOXC2Q99958 501 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 RBSNQ9H1K0 784 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 GTF3C1Q12789 2109 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0G2JNJ9 132 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TRBC2A0A5B9 178 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FAM166BA8MTA8 275 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 G3V3Y1 287 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FCHO1O14526 889 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CTAG2O75638 210 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 MYO1DO94832 1006 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FGGP02679 453 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 C8GP07360 202 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 GLI4P10075 376 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 PAMP19021 973 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 KLK2P20151 261 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 JAK1P23458 1154 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 GRK3P35626 688 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ADH7P40394 386 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CLCN2P51788 898 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CDKN2DP55273 166 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 MYBPHQ13203 477 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 DUPD1Q68J44 220 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TTC27Q6P3X3 843 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 B3GNT7Q8NFL0 401 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 NEIL2Q969S2 332 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 NCLNQ969V3 563 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TTYH2Q9BSA4 534 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 HAUS8Q9BT25 410 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 Q9UFV3 132 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.84□□□□□ -1.15
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0G2JN53 185 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-208ENST00000479480 FAM221AA4D161 298 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-208ENST00000479480 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-208ENST00000479480 WWP2O00308 870 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-208ENST00000479480 PROM1O43490 865 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-208ENST00000479480 OR2J2O76002 312 aa7.83□□□□□ -1.16
CTPS1-208ENST00000479480 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms