RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CLPSL1A2RUU4 121 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ARRDC5A6NEK1 342 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SFI1A8K8P3 1242 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NPIPB9F8W1W9 429 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PLK4O00444 970 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 HSPB6O14558 160 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 APAF1O14727 1248 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 RAD51BO15315 384 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SGTAO43765 313 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 DFNA5O60443 496 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NPM3O75607 178 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 OR4F21O95013 312 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 EML2O95834 649 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH1A1P00352 501 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PAHP00439 452 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 MT-ATP8P03928 68 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 VTNP04004 478 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 LYNP07948 512 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NGFRP08138 427 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 QDPRP09417 244 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 LINGO3P0C6S8 592 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PIRTP0C851 137 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NAT2P11245 290 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SFTPCP11686 197 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 JUPP14923 745 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NPPBP16860 134 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CD40P25942 277 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CHMLP26374 656 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ALDH4A1P30038 563 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CD52P31358 61 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PPM1AP35813 382 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 GGCXP38435 758 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CEACAM6P40199 344 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 KCNJ4P48050 445 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TPTEP56180 551 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 HSD11B2P80365 405 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SLC34A1Q06495 639 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF33BQ06732 778 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CDK18Q07002 472 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 FUT5Q11128 374 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 RALGDSQ12967 914 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SERTAD2Q14140 314 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 GALNT3Q14435 633 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NECTIN1Q15223 517 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 POU4F3Q15319 338 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NPTX1Q15818 432 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 E2F4Q16254 413 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SPINK13Q1W4C9 94 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA0753Q2KHM9 967 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF684Q5T5D7 378 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 FAAH2Q6GMR7 532 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 OR4F3Q6IEY1 312 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 DENND5AQ6IQ26 1287 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TSSK4Q6SA08 328 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 C16orf89Q6UX73 402 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 LRIG3Q6UXM1 1119 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TIFABQ6ZNK6 161 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZRP5 223 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZSV7 163 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ARCQ7LC44 396 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TCF23Q7RTU1 214 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 GPR142Q7Z601 462 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ERICH1Q86X53 443 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 FAM131BQ86XD5 332 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 CDC20BQ86Y33 519 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC8AQ8IWT6 810 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 LGI2Q8N0V4 545 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 NUP93Q8N1F7 819 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 GHDCQ8N2G8 530 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SPATA6LQ8N4H0 392 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 ARRDC1Q8N5I2 433 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SMYD1Q8NB12 490 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 GATD1Q8NB37 220 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 UXS1Q8NBZ7 420 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 OR4S1Q8NGB4 309 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 OR4E2Q8NGC2 313 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 Q8TAT8 98 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 URGCPQ8TCY9 931 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM37Q8WXS4 190 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 SHC3Q92529 594 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 IP6K1Q92551 441 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 HLA-CQ95604 372 aa-2.19□□□□□ -2.76
SNORD54-201ENST00000459159 TP53INP1Q96A56 240 aa-2.19□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms