RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447117.1

PTENP1-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 1,215 nt, Biotype transcribed processed pseudogene, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-201ENST00000447117 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 STRADBQ9C0K7 418 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZWILCHQ9H900 591 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 KCNK13Q9HB14 408 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 IL1RAPQ9NPH3 570 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PDHXO00330 501 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 CTDSPLO15194 276 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 OGTO15294 1046 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ST8SIA3O43173 380 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 LMO2P25791 158 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 EVCP57679 992 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 CEACAM7Q14002 265 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 TMUB2Q71RG4 321 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 KRT77Q7Z794 578 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 OR8H3Q8N146 312 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SLC43A2Q8N370 569 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 C4orf32Q8N8J7 132 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SLC35C1Q96A29 364 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 RAB9BQ9NP90 201 aa3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 A8MU76 341 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SHISA9B4DS77 424 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 K7EQG2 157 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 M0R296 226 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 P2RX6O15547 441 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 C8orf89P0DMQ9 161 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 FOLR2P14207 255 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NOVP48745 357 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ATP4BP51164 291 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SLC3A1Q07837 685 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 MEP1BQ16820 701 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 C15orf32Q32M92 178 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 TEX35Q5T0J7 233 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 HECTD3Q5T447 861 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 AGAP6Q5VW22 663 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 Q6ZR54 194 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 Q71RC1 249 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NLRP14Q86W24 1093 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 FGFRL1Q8N441 504 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 OR7G3Q8NG95 312 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SAP25Q8TEE9 199 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SEPT8Q92599 483 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NABP1Q96AH0 204 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF577Q9BSK1 485 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 IDI2Q9BXS1 227 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SRD5A3Q9H8P0 318 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 NMUR1Q9HB89 426 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 TMEM161AQ9NX61 479 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 THYN1Q9P016 225 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 RARRES3Q9UL19 164 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 AUP1Q9Y679 476 aa3.51□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 FAM149AA5PLN7 773 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 CCSO14618 274 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SLU7O95391 586 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 IGHG1P01857 330 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ACKR3P25106 362 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 LIMK2P53671 638 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 BACE1P56817 501 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ROR1Q01973 937 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 C3AR1Q16581 482 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.5□□□□□ -1.85
PTENP1-201ENST00000447117 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms