RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
LMO1-202ENST00000428101 RAB38P57729 211 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PDK4Q16654 411 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SYT10Q6XYQ8 523 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CMC1Q7Z7K0 106 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CCDC25Q86WR0 208 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 GPR137Q96N19 417 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 RAB17Q9H0T7 212 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 RNF112Q9ULX5 631 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 B3GALT2O43825 422 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SLC25A12O75746 678 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 MYO1DO94832 1006 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SLC35E2BP0CK96 405 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ABHD17CQ6PCB6 329 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ISCA2Q86U28 154 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 B3GNT7Q8NFL0 401 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 FBF1Q8TES7 1133 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CCDC120Q96HB5 630 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 DEFB126Q9BYW3 111 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ALG9Q9H6U8 611 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 A0A088AWK7 358 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CCL21O00585 134 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PPP2R1BP30154 601 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CYB561P49447 251 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 GPR143P51810 404 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 HSD17B7P56937 341 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 GUCY2DQ02846 1103 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 RBPJQ06330 500 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 E2F2Q14209 437 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TERF2Q15554 542 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 LURAP1LQ8IV03 231 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SIAH3Q8IW03 269 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 FAM47BQ8NA70 645 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 EXT2Q93063 718 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SERINC2Q96SA4 455 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CD244Q9BZW8 370 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PRDM7Q9NQW5 492 aa25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 NPIPA5E9PKD4 350 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CYR61O00622 381 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 NME2P1O60361 137 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SLC19A2O60779 497 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 NME2P22392 152 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CERS1P27544 350 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 STX2P32856 288 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 HLCSP50747 726 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 LIM2P55344 173 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CHIT1Q13231 466 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TBCCQ15814 346 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 KRTCAP3Q53RY4 240 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 RAPH1Q70E73 1250 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SLC34A3Q8N130 599 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 F2RL3Q96RI0 385 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ATOH8Q96SQ7 321 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CSF3RQ99062 836 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 IGSF5Q9NSI5 407 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 DAPP1Q9UN19 280 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 NPIPA1Q9UND3 350 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ZNF835Q9Y2P0 537 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CLDN4O14493 209 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 TFEBP19484 476 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CASP2P42575 452 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CLCN2P51788 898 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 MTTPP55157 894 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 IRF8Q02556 426 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SLC13A2Q13183 592 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 LAPTM5Q13571 262 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SLMAPQ14BN4 828 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 UBE3DQ7Z6J8 389 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ZNF595Q8IYB9 648 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 NMRAL1Q9HBL8 299 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 NUDT4Q9NZJ9 180 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 FCHO1O14526 889 aa25.4■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 S100BP04271 92 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 CRABP2P29373 138 aa25.4■■□□□ 1.66
LMO1-202ENST00000428101 C3AR1Q16581 482 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms