RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIAPH2O60879 1101 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BANF1O75531 89 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R1BP30154 601 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR143P51810 404 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R3AQ16821 1122 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HECTD2Q5U5R9 776 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR5M3Q8NGP4 307 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAL3ST3Q96A11 431 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CERS2Q96G23 380 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MS4A14Q96JA4 679 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPF1Q9NWY4 346 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A14Q9Y267 594 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN16Q9Y5I7 305 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNE2Q9Y6J6 123 aa12.25□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM166BA8MTA8 275 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA2E9PIF3 369 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFBR3LH3BV60 316 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFAND5O76080 213 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B7P56937 341 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB38P57729 211 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTN3A2P78410 334 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLGLB1Q02325 96 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PMPCAQ10713 525 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM45BPQ6NSW5 357 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2M7Q8NG81 312 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM45AQ8TCE6 357 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRK7Q8WTQ7 553 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASB15Q8WXK1 588 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POM121Q96HA1 1249 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAR2Q96K12 515 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTTY12Q9BZ98 90 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAP2Q9NPF8 381 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPLA3Q9NST1 481 aa12.24□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC13O75165 2243 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITPR3Q14573 2671 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JMM0 328 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0G2JN53 185 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPB8 328 aa12.23□□□□□ -0.45
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM200CA6NKL6 621 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR3DP1A8MWS1 328 aa12.23□□□□□ -0.45
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6B1O95007 311 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAT1P21673 171 aa12.23□□□□□ -0.45
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC13A2Q13183 592 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYBPHQ13203 477 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RUNX2Q13950 521 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS9Q3SYG4 887 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GXYLT1Q4G148 440 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CES4AQ5XG92 561 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS9BPQ6ZS82 235 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A16Q86VW1 577 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM52Q8NDY8 209 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMC6Q96SB8 1091 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT9Q9BTE0 207 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VWA7Q9Y334 891 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIPGQ9Y5X9 500 aa12.23□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR14I1A6ND48 311 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN4O14493 209 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERI3O43414 337 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRDCO43847 1150 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZWINTO95229 277 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACVR2AP27037 513 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOX3P41225 446 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNTAP49354 379 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCZ1BP86790 482 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSS51Q4VC12 460 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKR6Q5GH73 641 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa12.22□□□□□ -0.45
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL20RBQ6UXL0 311 aa12.22□□□□□ -0.45
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