RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 MFSD2AQ8NA29 543 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 MS4A6EQ96DS6 147 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 MAGIXQ9H6Y5 334 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 SLAMF7Q9NQ25 335 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 FAM170BA6NMN3 283 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 ETFAP13804 333 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 IL1RNP18510 177 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 IST1P53990 364 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 VAC14Q08AM6 782 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 HEPACAMQ14CZ8 416 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 TRIM48Q8IWZ4 208 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D19Q8N5T2 526 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 SLC6A18Q96N87 628 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 OR2A14Q96R47 310 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 SARGQ9BW04 601 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 SPATA9Q9BWV2 254 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 DNAJB9Q9UBS3 223 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.02■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 OR6C74A6NCV1 312 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ERI3O43414 337 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TBX19O60806 448 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SOAT1P35610 550 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MYBPC1Q00872 1141 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 C1orf61Q13536 156 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SPIDRQ14159 915 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ADPRMQ3LIE5 342 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR52E8Q6IFG1 317 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 EID3Q8N140 333 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TRIML2Q8N7C3 387 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR10G6Q8NH81 332 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TFAP2CQ92754 450 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FCRL4Q96PJ5 515 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CXorf36Q9H7Y0 433 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PRDM7Q9NQW5 492 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa17.02■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ZW10O43264 779 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 VIPP01282 170 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 VEZF1Q14119 521 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SLC5A12Q1EHB4 618 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TJAP1Q5JTD0 557 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ABHD17CQ6PCB6 329 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TAF8Q7Z7C8 310 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CARM1Q86X55 608 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 RNF130Q86XS8 419 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 OR8K5Q8NH50 307 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GPR27Q9NS67 375 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CPNE7Q9UBL6 633 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SNX8Q9Y5X2 465 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GON4LQ3T8J9 2241 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PDPK1O15530 556 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ZNF217O75362 1048 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF21O75509 655 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FAM58BPP0C7Q3 252 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 UGT2B7P16662 529 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 RPS9P46781 194 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SLAMF1Q13291 335 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DS3Q14952 304 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 FBXO42Q6P3S6 717 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SLC22A18Q96BI1 424 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 C8orf4Q9NR00 106 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SCN3AQ9NY46 2000 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 RPS6KA6Q9UK32 745 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GSAPA4D1B5 854 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GNGT2O14610 69 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CTSEP14091 401 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 UQCRC2P22695 453 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 GSTM2P28161 218 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 AQP1P29972 269 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PCGF2P35227 344 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CRYBA2P53672 197 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MANFP55145 182 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 RAB8AP61006 207 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MERTKQ12866 999 aa17■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CBLL1Q75N03 491 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms