RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 KRT12Q99456 494 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 RHBGQ9H310 441 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PSAT1Q9Y617 370 aa11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MED13LQ71F56 2210 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 A8MUA0 341 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CDC7O00311 574 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CLDN14O95500 239 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MLYCDO95822 493 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 AHRP35869 848 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ELK3P41970 407 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CYB561P49447 251 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CBLBQ13191 982 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 STEAP4Q687X5 459 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CA13Q8N1Q1 262 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FAM45AQ8TCE6 357 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ATL1Q8WXF7 558 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SMIM10Q96HG1 83 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PELI2Q9HAT8 420 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SLC22A14Q9Y267 594 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 VWA7Q9Y334 891 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.31□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 HCFC1P51610 2035 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 A0A0G2JN53 185 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MYO1DO94832 1006 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MEOX1P50221 254 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 HLCSP50747 726 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SKP1P63208 163 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MDGA2Q7Z553 956 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D19Q8N5T2 526 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ACBD4Q8NC06 268 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 LRRN4CLQ8ND94 238 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TMEM52Q8NDY8 209 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NAT9Q9BTE0 207 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TRIM54Q9BYV2 358 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ZFATQ9P243 1243 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.3□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SPG11Q96JI7 2443 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 A0A1B0GTH9 108 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 E9PLN8 166 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SERPINA6P08185 405 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SAT1P21673 171 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 GDF5P43026 501 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 GPR85P60893 370 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 BTN3A2P78410 334 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 DR1Q01658 176 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 RUNX2Q13950 521 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 CD163Q86VB7 1156 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 SULF2Q8IWU5 870 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 TRPV3Q8NET8 790 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 B3GNT7Q8NFL0 401 aa11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.29□□□□□ -0.6
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