RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 RIC8BQ9NVN3 520 aa18.04■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 TMEM216Q9P0N5 145 aa18.04■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 PCTPQ9UKL6 214 aa18.04■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 TMCO1Q9UM00 188 aa18.04■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 FAM227AF5H4B4 570 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 J3QKU1 62 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 OR7A17O14581 309 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 DPM1O60762 260 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 B4GALT2O60909 372 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ALPPP05187 535 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 LIPJQ5W064 366 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 IGFL2Q6UWQ7 119 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 Q8NA96 180 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 OR52B6Q8NGF0 335 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 UBE2E3Q969T4 207 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 FAR2Q96K12 515 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 CCDC77Q9BR77 488 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 MFRPQ9BY79 579 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 ACTR8Q9H981 624 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa18.03■□□□□ 0.48
SLC25A3-211ENST00000548847 A0A1W2PPM1 405 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 A8MT66 165 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 H0YIV9 168 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 GOLGA8RI6L899 631 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 UGDHO60701 494 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SMIM24O75264 130 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SERPINA7P05543 415 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 RPS17P08708 135 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 PYGBP11216 843 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 PCNAP12004 261 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 CERS1P27544 350 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 HSD17B3P37058 310 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 PIK3CGP48736 1102 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 BTG2P78543 158 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NSDHLQ15738 373 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC6A19Q695T7 634 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 QSOX2Q6ZRP7 698 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 LCA5Q86VQ0 697 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TDRPQ86YL5 185 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 CYP4X1Q8N118 509 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 AGAP4Q96P64 663 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.477e-15■□□□□ 8.3
SLC25A3-211ENST00000548847 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 KLHL41O60662 606 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TGFB1P01137 390 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 JAK1P23458 1154 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SOX11P35716 441 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SLCO1A2P46721 670 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TRAF3Q13114 568 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 CDK15Q96Q40 435 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 DMRT3Q9NQL9 472 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 LUZP4Q9P127 313 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 CLDN16Q9Y5I7 305 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 CSAG2Q9Y5P2 127 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 A0A1B0GTL3 188 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 RTCAO00442 366 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 B3GALT2O43825 422 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SH3BGRLO75368 114 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 ITGAMP11215 1152 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 MAOAP21397 527 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SERPINB1P30740 379 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 PIK3CBP42338 1070 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 MTTPP55157 894 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 MLLT10P55197 1068 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 RASA2Q15283 850 aa18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.47
SLC25A3-211ENST00000548847 SFT2D3Q587I9 215 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms