RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517183.1

SCARNA11.2-201, small Cajal body-specific RNA 11, humanhuman

BASIC

Gene SCARNA11, Length 154 nt, Biotype scaRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 OLR1P78380 273 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 GSTO1P78417 241 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 PPP2R2BQ00005 443 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 UBE3AQ05086 875 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ZNF415Q09FC8 603 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NIPAL4Q0D2K0 466 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 PTP4A2Q12974 167 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SLAQ13239 276 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TNK1Q13470 666 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SLC12A1Q13621 1099 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 GIT2Q14161 759 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 GGTLC2Q14390 218 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 OPCMLQ14982 345 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 HERPUD1Q15011 391 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RASA2Q15283 850 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RPS6KA1Q15418 735 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 BAK1Q16611 211 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CDKN3Q16667 212 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CA9Q16790 459 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ECSCRQ19T08 205 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 MICAQ29983 383 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ZNF674Q2M3X9 581 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 QRICH1Q2TAL8 776 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CNPY1Q3B7I2 92 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ZNF528Q3MIS6 628 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ABCA11PQ4W5N1 156 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CCDC38Q502W7 563 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SYT14P1Q58G82 188 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ARMCX4Q5H9R4 360 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SPANXN4Q5MJ08 99 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 EOGTQ5NDL2 527 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 DNLZQ5SXM8 178 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 FAM69AQ5T7M9 428 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SLC22A10Q63ZE4 541 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 OR4A47Q6IF82 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 IL34Q6ZMJ4 242 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 DET1Q7L5Y6 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 MOB1BQ7L9L4 216 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TMEM110Q86TL2 294 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 AACSQ86V21 672 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 MOGAT3Q86VF5 341 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 HOMEZQ8IX15 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CEP57L1Q8IYX8 460 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TTC5Q8N0Z6 440 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CADM2Q8N3J6 435 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ZNF781Q8N8C0 355 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SAMD12Q8N8I0 201 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 OR4K1Q8NGD4 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 UBALD1Q8TB05 177 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ETNPPLQ8TBG4 499 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SSMEM1Q8WWF3 244 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 FRZBQ92765 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 MARC2Q969Z3 335 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NXPE2Q96DL1 559 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 PDXPQ96GD0 296 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 APOPT1Q96IL0 206 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 COG8Q96MW5 612 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RCHY1Q96PM5 261 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 BTBD9Q96Q07 612 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NCAPGQ9BPX3 1015 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NRIP2Q9BQI9 281 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 FNDC11Q9BVV2 318 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 PCGF6Q9BYE7 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 SPNS1Q9H2V7 528 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 DPAGT1Q9H3H5 408 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 KCNK13Q9HB14 408 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NMUR1Q9HB89 426 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 Q9N2K0 584 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 NLRC4Q9NPP4 1024 aa-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
SCARNA11.2-201ENST00000517183 ABCC13Q9NSE7 274 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms