RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	S100A13	Q99584	98 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MKLN1	Q9UL63	735 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EVPL	Q92817	2033 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL33	A6NCF5	533 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CCRL2	O00421	344 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GABBR2	O75899	941 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRAMEF12	O95522	483 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A8	O95907	504 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CEL	P19835	753 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PGD	P52209	483 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DCDC1	P59894	354 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PHC1	P78364	1004 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PDGFRL	Q15198	375 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SCAI	Q8N9R8	606 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GRHL3	Q8TE85	626 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	F2RL3	Q96RI0	385 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA1C	Q13936	2221 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAM25E	A8MYX2	175 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PLOD2	O00469	737 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN4	O14493	209 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TEX28	O15482	410 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	B3GALT2	O43825	422 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TFPI	P10646	304 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ADRA1A	P35348	466 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SPINT3	P49223	89 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TBPL1	P62380	186 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ID2	Q02363	134 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC3A1	Q07837	685 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC5A8	Q8N695	610 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NT5C3B	Q969T7	300 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SCRN2	Q96FV2	425 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GINS4	Q9BRT9	223 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HCST	Q9UBK5	93 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MUSK	O15146	869 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR12D1	P0DN82	309 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GSTM3	P21266	225 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HSD17B2	P37059	387 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OPRL1	P41146	370 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM25	Q86YD3	366 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TTL	Q8NG68	377 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	POF1B	Q8WVV4	589 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM80	Q96HE8	168 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	WAC	Q9BTA9	647 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MND1	Q9BWT6	205 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CHIA	Q9BZP6	476 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RNF186	Q9NXI6	227 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GPR83	Q9NYM4	423 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	XKRY	O14609	159 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MATN1	P21941	496 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CLCN2	P51788	898 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ST3GAL3	Q11203	375 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KRT77	Q7Z794	578 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMC8	Q8IU68	726 aa		7.75	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17

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