RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ALG11Q2TAA5 492 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 Q6ZSR6 202 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT13Q86X67 352 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 RGMAQ96B86 450 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 MAGIXQ9H6Y5 334 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 G3V2T6 193 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 APBB3O95704 486 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 C7P10643 843 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 DDCP20711 480 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 AKT2P31751 481 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SLC36A3Q495N2 470 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 UCN3Q969E3 161 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 MTERF3Q96E29 417 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINB1P30740 379 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC74AQ0VAA2 488 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 OR13H1Q8NG92 308 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM4Q9C037 500 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SNX8Q9Y5X2 465 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.12■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 LRIT2A6NDA9 550 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 DIRAS1O95057 198 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 GRK3P35626 688 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SPESP1Q6UW49 350 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 RNF130Q86XS8 419 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 EID3Q8N140 333 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf4Q9NR00 106 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ABCG2Q9UNQ0 655 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TRBC2A0A5B9 178 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 hCG_2039718K7EN88 272 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 NOBOXO60393 691 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 E2F6O75461 281 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ALPLP05186 524 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 IGHV4-34P06331 123 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH3A2P51648 485 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 CRYBA2P53672 197 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TPD52L3Q96J77 140 aa22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 C4orf51C9J302 202 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 CLEC3AO75596 197 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 GLULP15104 373 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 PRKACGP22612 351 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SLC19A1P41440 591 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SSR2P43308 183 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 DAG1Q14118 895 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 DHRSXQ8N5I4 330 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 HSH2DQ96JZ2 352 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.1■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP9O95302 570 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 IL1RNP18510 177 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 VEZF1Q14119 521 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.09■■□□□ 1.13
FAAP20-209ENST00000428120 PATE1Q8WXA2 126 aa22.09■■□□□ 1.13
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