RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 A0A0A6YYD5 115 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 A0A1W2PRB8 838 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ACOX3O15254 700 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF217O75362 1048 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 AHRP35869 848 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SSR2P43308 183 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GSTM5P46439 218 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PLA2G16P53816 162 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RGNQ15493 299 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ADRM1Q16186 407 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 IYDQ6PHW0 289 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PAQR7Q86WK9 346 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 AMER3Q8N944 861 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CNBD2Q96M20 576 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLC6A18Q96N87 628 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 BDH2Q9BUT1 245 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SARGQ9BW04 601 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OSBPL11Q9BXB4 747 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLC6A16Q9GZN6 736 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KLHL31Q9H511 634 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SCOCQ9UIL1 159 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 XIRP2A4UGR9 3374 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FAM170BA6NMN3 283 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PPM1DO15297 605 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RASAL1O95294 804 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NTRK1P04629 796 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NUDT7P0C024 238 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FOSL2P15408 326 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 IL1RNP18510 177 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ALDH9A1P49189 494 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 HYAL2Q12891 473 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 GPR18Q14330 331 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KIR2DS3Q14952 304 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UGT2A3Q6UWM9 527 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM73Q86UV7 250 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 EID3Q8N140 333 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PATE1Q8WXA2 126 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TRIM4Q9C037 500 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TWSG1Q9GZX9 223 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NTN4Q9HB63 628 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C8orf4Q9NR00 106 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TAS2R9Q9NYW1 312 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UTS2RQ9UKP6 389 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.86□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FANCMQ8IYD8 2048 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 C4orf51C9J302 202 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UPK1AO00322 258 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 AXIN1O15169 862 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZW10O43264 779 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PRSS23O95084 383 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 VIPP01282 170 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SOAT1P35610 550 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MVDP53602 400 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 HEPACAMQ14CZ8 416 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF793Q6ZN11 406 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 Q7L0L9 218 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 NAGSQ8N159 534 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MFSD2AQ8NA29 543 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PYURFQ96I23 114 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ABCG4Q9H172 646 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF639Q9UID6 485 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.85□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 EI24O14681 340 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 PDPK1O15530 556 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF682O95780 498 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 UGT2B7P16662 529 aa11.84□□□□□ -0.51
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF23P17027 643 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms