RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323929.7

MRE11-201, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRE11, Length 6,897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-201ENST00000323929 TRAM2Q15035 370 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 HHLA1C9JL84 531 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 BTN3A3O00478 584 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TP53I11O14683 189 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TIMP2P16035 220 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ALDH3A2P51648 485 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MVKQ03426 396 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 DOC2AQ14183 400 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ATP6AP1Q15904 470 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MCFD2Q8NI22 146 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 FGF13Q92913 245 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 IL17CQ9P0M4 197 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TAF1P21675 1872 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 SH3PXD2BA1X283 911 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 GFRA2O00451 464 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 BMP8BP34820 402 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 GALK1P51570 392 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 AP3S2P59780 193 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PITPNAQ00169 270 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 SLAMF1Q13291 335 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 NPTX1Q15818 432 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 USP30Q70CQ3 517 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 OR2L2Q8NH16 312 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 CD200R1Q8TD46 325 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MR1Q95460 341 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TGM7Q96PF1 710 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 GPER1Q99527 375 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PTGES2Q9H7Z7 377 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 IL21RQ9HBE5 538 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 NCDNQ9UBB6 729 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 STATHP02808 62 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MT-ND1P03886 318 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ARSFP54793 590 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 RHDQ02161 417 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 OSTF1Q92882 214 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 RNF121Q9H920 327 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 HYKKA2RU49 373 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 FAAHO00519 579 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 POU2F1P14859 743 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 IL4RP24394 825 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 CLDN8P56748 225 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 NUP43Q8NFH3 380 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PIK3R3Q92569 461 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 COPS4Q9BT78 406 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.25□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 EI24O14681 340 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 F11P03951 625 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 AHCYP23526 432 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 GK3PQ14409 553 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 BICRALQ6AI39 1079 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 LIN54Q6MZP7 749 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 PNCKQ6P2M8 343 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 IQCHQ86VS3 1027 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 HHEXQ03014 270 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 KCNC4Q03721 635 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 SYT16Q17RD7 645 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 MLIPQ5VWP3 458 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
MRE11-201ENST00000323929 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms