RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CTSF	Q9UBX1	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A1W2PPM1	405 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SHOX	O15266	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	DLX3	O60479	287 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MATN4	O95460	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	HEXB	P07686	556 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NR1D1	P20393	614 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	HMOX2	P30519	316 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CCNG1	P51959	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	UCN	P55089	124 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	BTN3A2	P78410	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	FAP	Q12884	760 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ASPG	Q86U10	573 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PCM1	Q15154	2024 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A087X1B8	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	HBQ1	P09105	142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CD1D	P15813	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	HSD17B3	P37058	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SSR2	P43308	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CCT5	P48643	541 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ARSF	P54793	590 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	DLG1	Q12959	904 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CDC16	Q13042	620 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SP140	Q13342	867 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PDK4	Q16654	411 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MDFI	Q99750	246 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	DDA1	Q9BW61	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	POLH	Q9Y253	713 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MYO1C	O00159	1063 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	GBA	P04062	536 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RBP1	P09455	135 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ITGAX	P20702	1163 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	KCNC1	P48547	511 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	EMP2	P54851	167 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ABAT	P80404	500 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MC1R	Q01726	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NAB1	Q13506	487 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NR1D2	Q14995	579 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.72	□□□□□ -1.65

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