RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGP20916 626 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL2RGP31785 369 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSMD8P48556 350 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CRYBA2P53672 197 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DIO3P55073 304 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GCKRQ14397 625 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ECSCRQ19T08 205 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHRFAM7AQ494W8 412 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OLFM4Q6UX06 510 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GCNT7Q6ZNI0 430 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LINC00336Q6ZUF6 198 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q71RC1 249 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEP57Q86XR8 500 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF595Q8IYB9 648 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARNTL2Q8WYA1 636 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCT6BQ92526 530 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 JAKMIP2Q96AA8 810 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEK1Q96PY6 1258 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NDNQ99608 321 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC2A11Q9BYW1 496 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF221Q9UK13 617 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXL4Q9UKA2 621 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PILRBQ9UKJ0 227 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF150Q9ULK6 438 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NPHP3Q7Z494 1330 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LAMB2P55268 1798 aa0.04□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBN2P35556 2912 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A1B0GUA9 196 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHGR1C9JFL3 82 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANHXE9PGG2 379 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RTN2O75298 545 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNMTP11086 282 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SKILP12757 684 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 F3P13726 295 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IRF2P14316 349 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DNASE1P24855 282 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACSL1P33121 698 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ALDH3B1P43353 468 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRAPPC10P48553 1259 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 P2RY4P51582 365 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TLE2Q04725 743 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNK1Q13470 666 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASAH1Q13510 395 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPS6KA1Q15418 735 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPATA46Q5T0L3 261 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 REP15Q6BDI9 236 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTR9Q6PD62 1173 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q6ZVQ6 151 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NAA40Q86UY6 237 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF695Q8IW36 515 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 XXYLT1Q8NBI6 393 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBCKQ8TEA7 893 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZUFSPQ96AP4 578 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPDL1Q96EA4 605 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC39A13Q96H72 371 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GUCD1Q96NT3 240 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BTBD9Q96Q07 612 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPS6KC1Q96S38 1066 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF702PQ9H963 129 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NANOGQ9H9S0 305 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C3orf14Q9HBI5 128 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POLKQ9UBT6 870 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLAGL1Q9UM63 463 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNF24Q9Y225 148 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NME7Q9Y5B8 376 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL16Q14005 1332 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOTCH1P46531 2555 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SHANK1Q9Y566 2161 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LNP1A1A4G5 178 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A8MVM7 634 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LMO7DNF2Z398 122 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRAMEF11O60813 436 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UFL1O94874 794 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPA1P27694 616 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FEN1P39748 380 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF131P52739 623 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EVCP57679 992 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF45Q02386 682 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms