RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 HMOX2P30519 316 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 HTR7P34969 479 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 COILP38432 576 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 CETN2P41208 172 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 KIR2DL3P43628 341 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 SLCO1A2P46721 670 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 DCDC1P59894 354 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 MMEL1Q495T6 779 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 OTOAQ7RTW8 1153 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 PRELID2Q8N945 189 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 CCDC89Q8N998 374 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 CHPT1Q8WUD6 406 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 EID2BQ96D98 161 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 HES7Q9BYE0 225 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 PSMD13Q9UNM6 376 aa11.07□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 TM9SF1O15321 606 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 IDH3BO43837 385 aa11.06□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 ALDH3B2P48448 385 aa11.06□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.644e-10■■■■□ 20.9
HCG18-241ENST00000602290 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa11.05□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 TMEM114B3SHH9 223 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.05□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 BTN3A1O00481 513 aa11.05□□□□□ -0.64
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HCG18-241ENST00000602290 PTGER1P34995 402 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.644e-17■■□□□ 12.4
HCG18-241ENST00000602290 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HCG18-241ENST00000602290 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.05□□□□□ -0.64
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