RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570569.1

TMEM256-PLSCR3-201, Transcript of TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 3

Gene TMEM256-PLSCR3, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SHISA5Q8N114 240 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KRT78Q8N1N4 520 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SIRT6Q8N6T7 355 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 OR5T3Q8NGG3 340 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KIAA1191Q96A73 305 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CD274Q9NZQ7 290 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RNF112Q9ULX5 631 aa16.06■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 OR2W5A6NFC9 320 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CLGNO14967 610 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TAPBPO15533 448 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 STK16O75716 305 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SERPINA6P08185 405 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CELA2AP08217 269 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SOX11P35716 441 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RAB8AP61006 207 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ARG2P78540 354 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NSDHLQ15738 373 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 FHL5Q5TD97 284 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ANKRD37Q7Z713 158 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PLPP5Q8NEB5 264 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MNS1Q8NEH6 495 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TTLQ8NG68 377 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NMRAL1Q9HBL8 299 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SCN2AQ99250 2005 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 B3GALT4O96024 378 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 FHP07954 510 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ITGAMP11215 1152 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 JAK1P23458 1154 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PHBP35232 272 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HSPA7P48741 367 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 OLR1P78380 273 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 RHAGQ02094 409 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ABRAXAS2Q15018 415 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 BTBD16Q32M84 506 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SNX31Q8N9S9 440 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CATSPER1Q8NEC5 780 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 OR1N1Q8NGS0 311 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 EXT2Q93063 718 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 KLHL31Q9H511 634 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ALG9Q9H6U8 611 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 NT5DC2Q9H857 520 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 LANCL2Q9NS86 450 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PLA2G3Q9NZ20 509 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 ACOT9Q9Y305 439 aa16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 CTAGE15A4D2H0 777 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 A8MUI8 341 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 B4GALT2O60909 372 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 DNAJB6O75190 326 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TUBB4AP04350 444 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 SMIM10L1P0DMW3 83 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 TFEBP19484 476 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 GSTM2P28161 218 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 HYAL2Q12891 473 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.163e-7■■■□□ 15.1
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 PDK4Q16654 411 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM256-PLSCR3-201ENST00000570569 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms