RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479230.5

GNL3-208, Transcript of G protein nucleolar 3, human

TSL 4

Gene GNL3, Length 547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNL3-208	ENST00000479230	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	QDPR	P09417	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	F3	P13726	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	AADAC	P22760	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	NPY4R	P50391	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SLC8A3	P57103	927 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TSPY1	Q01534	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RAPSN	Q13702	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	P2RX5	Q93086	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230		A0A1W2PPW3	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SLC1A7	O00341	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SURF4	O15260	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CD59	P13987	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SHC1	P29353	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RGS7	P49802	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	OR1D5	P58170	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	DSCR10	P59022	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MS4A2	Q01362	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PSMD6	Q15008	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	METTL4	Q8N3J2	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	RNF121	Q9H920	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PANK3	Q9H999	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	HACD3	Q9P035	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SLIT1	O75093	1534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CPS1	P31327	1500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZFYVE9	O95405	1425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CYTIP	O60759	359 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MYOG	P15173	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TCF4	P15884	667 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	PDHA2	P29803	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MFAP3	P55082	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	UGCG	Q16739	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	NSMAF	Q92636	917 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	LGMN	Q99538	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GNL3-208	ENST00000479230	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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