RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 HBEGFQ99075 208 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINI1Q99574 410 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ZPBPQ9BS86 351 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 NUF2Q9BZD4 464 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 THSD1Q9NS62 852 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC39A1Q9NY26 324 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RARRES3Q9UL19 164 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SPTBN2O15020 2390 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC28A1O00337 649 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 PLPP1O14494 284 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 NDUFS4O43181 175 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS4BO75351 444 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CRCPO75575 148 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL18O94889 574 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFSF15O95150 251 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 MED26O95402 600 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ONECUT2O95948 504 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SPINK2P20155 84 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 BSGP35613 385 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 IDH3AP50213 366 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 AQP5P55064 265 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP4F2P78329 520 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 HMGCS1Q01581 520 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 MC2RQ01718 297 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 IL11RAQ14626 422 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 HKDC1Q2TB90 917 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TCTE1Q5JU00 501 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CHSY3Q70JA7 882 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 METTL4Q8N3J2 472 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 OR2L5Q8NG80 312 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 OR1L3Q8NH93 324 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC13A3Q8WWT9 602 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 QRFPRQ96P65 431 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 OR6C1Q96RD1 312 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TAAR9Q96RI9 348 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 EBF4Q9BQW3 602 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF385DQ9H6B1 395 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 NPHS2Q9NP85 383 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 FGF21Q9NSA1 209 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAM29Q9UKF5 820 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 SPTBP11277 2137 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A0A6YYD5 115 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TXNDC9O14530 226 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RGS14O43566 566 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 LINC00032P0C843 101 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 KITP10721 976 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 PCNAP12004 261 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ITIH1P19827 911 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ITGAXP20702 1163 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 CD82P27701 267 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 EPHA3P29320 983 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 ITGA1P56199 1179 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 PHEXP78562 749 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RGS1Q08116 209 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM53BQ14153 422 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 RTP5Q14D33 572 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 GPR19Q15760 415 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP4-207ENST00000454947 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms