RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 RGNQ15493 299 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM217AQ8IXS0 508 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ECHDC3Q96DC8 303 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3BP4Q9P0V3 963 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SERTM1A2A2V5 107 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R082 166 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GADD45AP24522 165 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 COLEC12Q5KU26 742 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM25Q86YD3 366 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FIBINQ8TAL6 211 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SGK2Q9HBY8 427 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM229AB2RXF0 380 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF11BO00300 401 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDH7O60245 1069 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DBTP11182 482 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1E2P47887 323 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 IDH2P48735 452 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TIGD6Q17RP2 521 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CCSMST1Q4G0I0 132 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MPPE1Q53F39 396 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GABARAPL3Q9BY60 117 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL25Q9H0H3 589 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST8Q9H2A9 424 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RLIMQ9NVW2 624 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG2BQ96BY7 2078 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf226A1L170 272 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGEF33A8MVX0 844 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A5O15375 505 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PCSK2P16519 638 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PBX2P40425 430 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RAE1P78406 368 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ELP6Q0PNE2 266 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF404Q494X3 552 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC103Q8IW40 242 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NPAS3Q8IXF0 933 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CPA6Q8N4T0 437 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DOHHQ9BU89 302 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD18Q9NS91 495 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OLFM2O95897 454 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CRATP43155 626 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC5A8Q8N695 610 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CHST14Q8NCH0 376 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HTRA1Q92743 480 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MGAT4DA6NG13 374 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOP08100 348 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HLA-FP30511 346 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GGT2P36268 569 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP27C1Q4G0S4 372 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS37AQ8NEZ2 397 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4A15Q8NGL6 344 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ASZ1Q8WWH4 475 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SORCS1Q8WY21 1168 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GGHQ92820 318 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFAF4Q9P032 175 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIL1Q9Y3C6 166 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT6Q9Y6F9 365 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0C4DFX4 3053 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PQ18 207 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R129 80 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSKP43235 329 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPHS1P49903 392 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 AGTRAPQ6RW13 159 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf65Q8NCR3 313 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 OR10G2Q8NGC3 310 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4K3Q96R72 315 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF167Q9H6Y7 350 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR83Q9NYM4 423 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP1-202ENST00000417536 PADI2Q9Y2J8 665 aa17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms