RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 KCNE2Q9Y6J6 123 aa7.24□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 RIPK2O43353 540 aa7.23□□□□□ -1.25
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SGMS1-201ENST00000361543 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB134Q4QY38 66 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-201ENST00000361543 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.23□□□□□ -1.25
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