RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-209ENST00000428120 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.83■■■□□ 2.21
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FAAP20-209ENST00000428120 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 PDIA6Q15084 440 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.82■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 HYPKQ9NX55 129 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 MRC1P22897 1456 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 MYL6BP14649 208 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 IL2RBP14784 551 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.81■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
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FAAP20-209ENST00000428120 KSR2Q6VAB6 950 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.8■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 NBR1Q14596 966 aa28.78■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 USP16Q9Y5T5 823 aa28.78■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 BTG4Q9NY30 223 aa28.77■■■□□ 2.2
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FAAP20-209ENST00000428120 TTC22Q5TAA0 569 aa28.77■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.77■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.77■■■□□ 2.2
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.76■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 FMNL2Q96PY5 1086 aa28.76■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.74■■■□□ 2.19
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FAAP20-209ENST00000428120 SSH3Q8TE77 659 aa28.72■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 SRGAP3O43295 1099 aa28.72■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.72■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 CDC45O75419 566 aa28.71■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.71■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.71■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 COPS6Q7L5N1 327 aa28.7■■■□□ 2.19
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH1L1O75891 902 aa28.69■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 SDSP20132 328 aa28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 SURF6O75683 361 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 PDE1AP54750 535 aa28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 LINS1Q8NG48 757 aa28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 POLA2Q14181 598 aa28.67■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 BECN1Q14457 450 aa28.67■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa28.66■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.66■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 GLI3P10071 1580 aa28.65■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.65■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV5-2P06315 115 aa28.64■■■□□ 2.18
FAAP20-209ENST00000428120 GRM8O00222 908 aa28.63■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.63■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.63■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 MYD88Q99836 296 aa28.63■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 MX1P20591 662 aa28.62■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.62■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.61■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.6■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 SUCLG2Q96I99 432 aa28.59■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.59■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.59■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF26B4DH59 902 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 ADAMTS2O95450 1211 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF14Q5TI25 921 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 NBPF15Q8N660 670 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 KAZALD1Q96I82 304 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 RAB11FIP3O75154 756 aa28.58■■■□□ 2.17
FAAP20-209ENST00000428120 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 MTX1Q13505 466 aa28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.56■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 A1BGP04217 495 aa28.55■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 GCKRQ14397 625 aa28.55■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 UTYO14607 1347 aa28.55■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 PIP4K2BP78356 416 aa28.55■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.54■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.54■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.54■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.53■■■□□ 2.16
FAAP20-209ENST00000428120 CASC1Q6TDU7 716 aa28.53■■■□□ 2.16
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