RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640507.1

SPIN3-240, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-240ENST00000640507 GNAZP19086 355 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SKP1P63208 163 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 RGS1Q08116 209 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 GPSM1Q86YR5 675 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 IQCKQ8N0W5 287 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SHISA5Q8N114 240 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 KIAA1191Q96A73 305 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.94□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 URADA6NGE7 173 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 TAPBPO15533 448 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 RDH16O75452 317 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SERPINA7P05543 415 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PCOLCEQ15113 449 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 ABHD13Q7L211 337 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PLPP5Q8NEB5 264 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PSMF1Q92530 271 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 ZNF592Q92610 1267 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 OR1F2PQ96R84 312 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.93□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SERPINA6P08185 405 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CRABP2P29373 138 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 AP2B1P63010 937 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 HYAL2Q12891 473 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CDC16Q13042 620 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 MFAP5Q13361 173 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 OR4D1Q15615 310 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 DEFB134Q4QY38 66 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 RAPH1Q70E73 1250 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CUZD1Q86UP6 607 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PDPRQ8NCN5 879 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SMIM10Q96HG1 83 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 WWOXQ9NZC7 414 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 COPG2Q9UBF2 871 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 STK16O75716 305 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 KCNC1P48547 511 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 AGTR2P50052 363 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 SLMAPQ14BN4 828 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 ISCA2Q86U28 154 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 RELL1Q8IUW5 271 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 MNS1Q8NEH6 495 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 TTLQ8NG68 377 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 C19orf60Q96EN9 201 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PEX11GQ96HA9 241 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-240ENST00000640507 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms