RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		13.4	□□□□□ -0.26
EDC4-210	ENST00000575507	TRBC2	A0A5B9	178 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	C4orf51	C9J302	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	MAP2K7	O14733	419 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	RDH16	O75452	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ALPP	P05187	535 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	PRR35	P0CG20	571 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	STX2	P32856	288 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	XCR1	P46094	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SCTR	P47872	440 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CDKL1	Q00532	357 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	DLG1	Q12959	904 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	TGFBI	Q15582	683 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	OR4D1	Q15615	310 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CPNE1	Q99829	537 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	KLHL31	Q9H511	634 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.39	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NDUFS4	O43181	175 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SERPIND1	P05546	499 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ABHD2	P08910	425 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CD1D	P15813	335 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	GRK3	P35626	688 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	GP5	P40197	560 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SLC6A12	P48065	614 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	REEP5	Q00765	189 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	NT5C	Q8TCD5	201 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CDKL2	Q92772	493 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	EGFL8	Q99944	293 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	PCM1	Q15154	2024 aa		13.38	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SPTA1	P02549	2419 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	HMX2	A2RU54	273 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	RIPK2	O43353	540 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	VPS4B	O75351	444 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	WDR47	O94967	919 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ACSL3	O95573	720 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ITGAM	P11215	1152 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	STMN1	P16949	149 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CXCR2	P25025	360 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SOX11	P35716	441 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	HNF4A	P41235	474 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	SLC12A2	P55011	1212 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	OLR1	P78380	273 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	PWP1	Q13610	501 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	ATCAY	Q86WG3	371 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.37	□□□□□ -0.27
EDC4-210	ENST00000575507	MREG	Q8N565	214 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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