RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SOX11	P35716	441 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	AHR	P35869	848 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GP5	P40197	560 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A12	P48065	614 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	MFAP5	Q13361	173 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	HERC3	Q15034	1050 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	AMER2	Q8N7J2	671 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5C	Q8TCD5	201 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CYTH2	Q99418	400 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH16	O75452	317 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CELA2A	P08217	269 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEA4	P43358	317 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC12A2	P55011	1212 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GUCY2D	Q02846	1103 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFBI	Q15582	683 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2W5	A6NFC9	320 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CD1D	P15813	335 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GDF5	P43026	501 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	HYAL2	Q12891	473 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	EGFL8	Q99944	293 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	LANCL2	Q9NS86	450 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SVIL	O95425	2214 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TAPBP	O15533	448 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJB6	O75190	326 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC166	P0CW27	439 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	STMN1	P16949	149 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ALOX12	P18054	663 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GGT5	P36269	586 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC25	Q86WR0	208 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1F2P	Q96R84	312 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ESYT3	A0FGR9	886 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CBX6	O95503	412 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ICAM2	P13598	275 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	IL10	P22301	178 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB10	P61026	200 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC7A5	Q01650	507 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS1	Q08116	209 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TLR1	Q15399	786 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4D1	Q15615	310 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB134	Q4QY38	66 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	GRTP1	Q5TC63	336 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	FBF1	Q8TES7	1133 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM10	Q96HG1	83 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	AICDA	Q9GZX7	198 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP10	Q9P2G4	905 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	COPG2	Q9UBF2	871 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PPP4C-205	ENST00000563200	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	20.53	■□□□□ 0.88

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