RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557168.1

TRAV30-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 30, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV30, Length 337 nt, Biotype TR V gene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30-201ENST00000557168 CTRCQ99895 268 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 MUC3BQ9H195 1237 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ADNPQ9H2P0 1102 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NANOGQ9H9S0 305 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 GPR27Q9NS67 375 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 RIC8BQ9NVN3 520 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ASIC5Q9NY37 505 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 IL36AQ9UHA7 158 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 VPS51Q9UID3 782 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CCL27Q9Y4X3 112 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 FADS3Q9Y5Q0 445 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 GMEB1Q9Y692 573 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LRP4O75096 1905 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 SVILO95425 2214 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 A0A1B0GTL3 188 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 A0A1B0GVG6 124 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 SERTM1A2A2V5 107 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 A8MU76 341 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 B4DGG1 531 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 UPK1AO00322 258 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NR5A2O00482 541 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CCL22O00626 93 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 E2F3O00716 465 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ARPC2O15144 300 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 B4GAT1O43505 415 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 FZD6O60353 706 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 SNX2O60749 519 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 VPS26AO75436 327 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 KATNA1O75449 491 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NDUFS3O75489 264 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TIPRLO75663 272 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ATP6AP2O75787 350 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 WDR47O94967 919 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CD160O95971 181 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CHEK2O96017 543 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 HPRP00739 348 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LDLRP01130 860 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PDGFAP04085 211 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LINC00032P0C843 101 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ADRB3P13945 408 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TSPAN8P19075 237 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 JAK1P23458 1154 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 HRH2P25021 359 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PCSK6P29122 969 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 IL12AP29459 219 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ALDH4A1P30038 563 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 FMO4P31512 558 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CCKBRP32239 447 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 UGT1A3P35503 534 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ETFBP38117 255 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CSNK1DP48730 415 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 HLCSP50747 726 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CLCN7P51798 805 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 DIO3P55073 304 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NUP107P57740 925 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 KCNK10P57789 538 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 IL2P60568 153 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PFN3P60673 137 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 HPCAP84074 193 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 LIPEQ05469 1076 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PRKG2Q13237 762 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF235Q14590 738 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PTPRCAPQ14761 206 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 RPS6KA2Q15349 733 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 NRF1Q16656 503 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 ALG11Q2TAA5 492 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAV30-201ENST00000557168 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms