RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAS1LP35410 378 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRCPP42785 496 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC6A11P48066 632 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDH15P55291 814 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C21orf59P57076 290 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2B6P58173 313 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPP2CBP62714 309 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPP2CAP67775 309 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IL9RQ01113 521 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GALK2Q01415 458 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAPTM4AQ15012 233 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STXBP2Q15833 593 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AMZ1Q400G9 498 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VSTM1Q6UX27 236 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZNX1 250 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PEX26Q7Z412 305 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKRD46Q86W74 232 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM129CQ86XR2 697 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFT20Q8IY31 132 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LNX2Q8N448 690 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NAT16Q8N8M0 369 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM116Q8NCL8 245 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACTL9Q8TC94 416 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FIG4Q92562 907 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP4K1Q92918 833 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLCO2A1Q92959 643 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ULK4Q96C45 1275 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RILPQ96NA2 401 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SNX18Q96RF0 628 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NPY6RQ99463 290 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAFAH2Q99487 392 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C12orf57Q99622 126 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OMDQ99983 421 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COPS4Q9BT78 406 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALG12Q9BV10 488 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FICDQ9BVA6 458 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HINT2Q9BX68 163 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLOD4Q9HC38 313 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CDYLQ9Y232 598 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SAMD9Q5K651 1589 aa6.85□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 M0QZK8 103 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CCSO14618 274 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABCD4O14678 606 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DPM1O60762 260 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CTNSO60931 367 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GUSBP08236 651 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSKH1P11801 424 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TGM2P21980 687 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLDCP23378 1020 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 S100PP25815 95 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SERPINA4P29622 427 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PPP2R1BP30154 601 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DLSTP36957 453 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAPK12P53778 367 aa6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PSME3P61289 254 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms