RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MPZP25189 248 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRKAR2BP31323 418 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPRP35270 261 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRCC3P46736 316 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDK3Q00526 305 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IKQ13123 557 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRPC3Q13507 836 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C16orf72Q14CZ0 275 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MED22Q15528 200 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PHKG1Q16816 387 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARMCX4Q5H9R4 360 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MUC21Q5SSG8 566 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C11orf63Q6NUN7 778 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL34Q6ZMJ4 242 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q6ZS52 159 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AACSQ86V21 672 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR137CQ8N3F9 429 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXO39Q8N4B4 442 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FRMD1Q8N878 549 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BANPQ8N9N5 519 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR4K1Q8NGD4 311 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXO30Q8TB52 745 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METTL6Q8TCB7 284 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ROBO4Q8WZ75 1007 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CASD1Q96PB1 797 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GPR88Q9GZN0 384 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMC4Q9NTJ3 1288 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF586Q9NXT0 402 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NENFQ9UMX5 172 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A0U1RQS6 177 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DLGAP1O14490 977 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AP3D1O14617 1153 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MEIS2O14770 477 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SIGLEC5O15389 551 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TPPPO94811 219 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR2T7P0C7T2 308 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MMP9P14780 707 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CD34P28906 385 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPS10P46783 165 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FNTAP49354 379 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TUBP50607 506 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VAMP7P51809 220 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPS8P62241 208 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRKCEQ02156 737 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAX5Q02548 391 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAP9Q49MG5 647 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPANXN4Q5MJ08 99 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CYB5D1Q6P9G0 228 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TEX38Q6PEX7 206 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUP54Q7Z3B4 507 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRRTM4Q86VH4 590 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMTC2Q8N394 836 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LINC01555Q8NAE3 123 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 METTL21AQ8WXB1 218 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NXPE2Q96DL1 559 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RCHY1Q96PM5 261 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HSD17B14Q9BPX1 270 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZMYND12Q9H0C1 365 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBC1D13Q9NVG8 400 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CA5BQ9Y2D0 317 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXO7Q9Y3I1 522 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WSB1Q9Y6I7 421 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCN2AQ99250 2005 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM150BA6NC51 233 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C2CD4DB7Z1M9 353 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 INPP4BO15327 924 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HS6ST1O60243 411 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DLATP10515 647 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACTN1P12814 892 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM11P17152 192 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PON1P27169 355 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HTR1FP30939 366 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms