RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 WDR26Q9H7D7 661 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SYNPO2LQ9H987 977 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FGF22Q9HCT0 170 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GPR27Q9NS67 375 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 USE1Q9NZ43 259 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PDP2Q9P2J9 529 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 UTS2RQ9UKP6 389 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OAZ3Q9UMX2 235 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SCML1Q9UN30 329 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MAPRE3Q9UPY8 281 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PRKAB1Q9Y478 270 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR1A2Q9Y585 309 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MTCH2Q9Y6C9 303 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AK5Q9Y6K8 562 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPC1 479 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FAM149AA5PLN7 773 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PDLIM1O00151 329 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CXCR6O00574 342 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PLPP1O14494 284 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 RFXANKO14593 260 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CLOCKO15516 846 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH7O60245 1069 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DPM1O60762 260 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LRATO95237 230 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HPRP00739 348 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LDLRP01130 860 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ALPLP05186 524 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GSNP06396 782 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HOXB2P14652 356 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DRD1P21728 446 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IL10P22301 178 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINB1P30740 379 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ALDH3B2P48448 385 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CSNK1G2P78368 415 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R2BQ00005 443 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PLIN5Q00G26 463 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF763Q0D2J5 394 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC74AQ0VAA2 488 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 HYAL2Q12891 473 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CCINQ13939 588 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 VEZF1Q14119 521 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CLCA4Q14CN2 919 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DEPDC1Q5TB30 811 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF425Q6IV72 752 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 DOK6Q6PKX4 331 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GPR180Q86V85 440 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 IFNEQ86WN2 208 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TDHQ8IZJ6 230 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EID3Q8N140 333 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP28Q8NHY6 868 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 PSMA8Q8TAA3 256 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 NETO1Q8TDF5 533 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf78Q8WTQ4 265 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 OR1E3Q8WZA6 343 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SMPDL3AQ92484 453 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2E3Q969T4 207 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 EME1Q96AY2 570 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 SH3KBP1Q96B97 665 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C7orf34Q96L11 122 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 CENPKQ9BS16 269 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 APOOQ9BUR5 198 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms