RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 CSHL1Q14406 222 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 C8orf74Q6P047 294 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 PPM1NQ8N819 430 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NT5CQ8TCD5 201 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 EGFL8Q99944 293 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 LANCL2Q9NS86 450 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ASB1Q9Y576 335 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 STMN1P16949 149 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 KCNC1P48547 511 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SLC12A2P55011 1212 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 PWP1Q13610 501 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 FRA10AC1Q70Z53 315 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ZADH2Q8N4Q0 377 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 AGAP4Q96P64 663 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 KLHL31Q9H511 634 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 HMX2A2RU54 273 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 KLHL41O60662 606 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 WDR47O94967 919 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ITGAMP11215 1152 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 STX2P32856 288 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 AHRP35869 848 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 HNMTP50135 292 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 RAB10P61026 200 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 OLR1P78380 273 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 RHAGQ02094 409 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 DEFB134Q4QY38 66 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 GRTP1Q5TC63 336 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ATCAYQ86WG3 371 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 IQCKQ8N0W5 287 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 TM9SF4Q92544 642 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ESAMQ96AP7 390 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 PEX11GQ96HA9 241 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CYTH2Q99418 400 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SERPINA7P05543 415 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SERPIND1P05546 499 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ALOX12P18054 663 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 EPORP19235 508 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CD22P20273 847 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 CXCR2P25025 360 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 ECHS1P30084 290 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 GGT5P36269 586 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 HSPA7P48741 367 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 MFAP5Q13361 173 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 SLMAPQ14BN4 828 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC24-201ENST00000423327 HERC3Q15034 1050 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms